Durante os dois turnos em que permanecem na escola, os alunos participam de diversas atividades complementares nas oficinas de informática e arte-educação, a exemplo de modelagem, pintura, desenho, estímulo à leitura e auto-expressão. Os alunos do ensino fundamental têm ainda acesso a práticas esportivas e à iniciação profissional por via das oficinas de papel machê, tecelagem, macramê e cerâmica, com o apoio do Instituto Mauá. Também passaram a freqüentar o cinema, graças à implantação da Cinemateca Daniela Mercury (batizada em homenagem à artista que doou o cachê em um evento para a instituição em 2006).

No programa de educação ambiental os estudantes têm aulas na área de produção de mudas de reflorestamento e plantas ornamentais, onde se desenvolve o curso profissionalizante de Jardinagem e Paisagismo. Eles também atuam como agentes mirins de proteção ambiental, ajudando a preservar espécies remanescentes da mata atlântica existentes no CESA e em seu entorno e participando de atividades de reflorestamento.